狗狗耳朵的皮肤和其他部位的皮肤构造并无不同，不过长耳狗和盖耳狗因为耳朵内部闷热，特别容易增生酵母菌，导致出现难闻的发酵气味。此时就必须要用药物改善情况，将酵母菌生长情况控制住。如果过分分泌油脂也是不正常状况，需要施药改善。
通常如果没有疾病产生，狗狗耳朵的气味并不会特别难闻。竖耳犬种或耳毛不多的犬种，耳朵都可以保持干燥和通风，自然不易生病。如果你家的狗狗刚好是盖耳犬种，建议每次洗澡之前，先帮它清理耳朵，拔耳毛，再滴一些清耳液在棉花棒上，将狗狗外部可见的耳壳部位轻轻擦拭一番，最后再滴几滴清耳液进入狗狗的耳朵里面，不用担心清耳液会在狗狗耳朵里面不出来，其实它会自行甩头将水排出，脏东西也会顺便甩出来的。
清理狗狗耳朵的方法
准备工具：1.宠物专用耳粉；2.拔耳毛专用夹；3.清耳液；4.棉花或纸面
1.将狗狗的耳朵翻开。
2.在狗狗的耳朵里撒上一些耳粉，让每一根耳毛都能更清晰，以便拔出耳毛。
提示：拔耳毛时，可请一个人帮忙，将拔毛夹（止血钳）放入耳朵里，轻轻将外耳道的毛拔除，可残留一点点的耳毛。
3.用拔耳毛夹将耳道内的杂毛拔除，道有分泌物也一并清楚干净。
4.将洁耳液滴入狗狗的耳朵里，让洁耳液完全进入耳道内部，量可以稍微多一点，—般滴2-3滴。
5.接着用手轻轻揉捏耳道的基部，柔捏耳道基部主要的目的是，要让耳道的分泌物及杂质可以剥落下来。最后将狗狗放开，它会自己甩头，甩头时会把耳道里的分泌物顺势甩到耳外，当它甩出来的时候，饲主再用棉花或面纸将这些甩出来的分泌物擦掉。不建议用棉花棒伸进狗狗的耳朵里去做清洁的动作，因为不正确的使用方式可能会造成耳道的感染或耳膜破裂。
只要饲主清理耳朵的步骤正确，有耳疾的狗狗恢复的效果会相当好。一般来说，除非是特异性的问题，例如，感染很严重的霉菌和细菌，而且已经产生很强的抗药性才会效果不明显。除此之外，像可卡这类的狗狗是覆耳式（耳朵盖住耳道的狗狗），因为环境气候的关系，比较容易反复出现耳朵疾病，所以耳朵的清洁就显得相当重要了。
